Un savant atomiste demi-fou, Von Krantz, a découvert un procédé permettant de désamorcer les armes nucléaires, l'Annulator. Von Krantz, infirme, vit enfermé dans sa villa avec sa fille, Sylvaine, et son assistant, Yvan, sur lesquels il exerce une tyrannie impitoyable. Les agents de diverses puissances étrangères tentent de s'emparer des plans de l'Annulator, et un véritable ballet d'espions va se dérouler autour de la villa de Von Krantz et de ses trois habitants...
Plus réalisateur de Court-métrage que de longs, Jean-Louis Roy n’en demeure pas moins un réalisateur phare du mouvement Groupe 5, l’équivalent de la Nouvelle Vague en France. Et « L’inconnu de Shandigore » est certainement l’une de ses œuvres les plus abouties et les plus emblématiques de sa vision et de son style cinématographique. A mi-chemin entre le film de science-fiction, ou d’anticipation et une sorte de critique d’une paranoïa ambiante, ce film est presque inclassable. Il fait évidemment penser au « Dr Folamour » de Stanley Kubrick, réalisé 3 années plus tôt en 1964, ou encore à « Alphaville » de son concitoyen Jean Luc Godard l’année suivante. Mais sa structure et son aspect parfois décousue et burlesque le classe au milieu de tout ça et en même temps en dehors, avec des acteurs qui surjouent, des scènes à la mise en scène parfois surprenante et aux personnages qui apparaissent comme dans une sorte d’énorme voyage shamanique, à l’instar de la scène avec l’apparition de la petite fille.
Jean-Louis Roy livre une œuvre inclassable, mais qui ne manque pourtant pas de qualité, d’abord parce que le réalisateur va utiliser le style futuriste et Arty de l’architecture de Gaudi, pour situer son action et va s’amuser à créer des plans soignés à l’extrême tout en étant tout autant épurés. La mise en scène de Roy et son scénario vont s’inspirer des films d’espionnage de l’époque et particulièrement James Bond qui en est déjà à sa quatrième aventure et dont la cinquième doit également sortir l’année même de sortie de « L’Inconnu de Shandigor », et en devenir une sorte de parodie, comme un acte de rébellion face à ce cinéma de divertissement qui se plie à une règle des plus classiques de la narration et n’hésite pas à repousser les frontières des cascades et du crédibles pour divertir les foules, sans les faire réfléchir.
Enfin « L’Inconnu de Shandigor » de Jean Loui Roy, c’est aussi l’occasion de retrouver dans un même générique des « Gueules », comme Daniel Emilfork (La Cité des Enfants Perdus), dans un rôle qui met toute la folie de son talent en valeur. Jacques Dufilho (C’est quoi la vie), autre acteur français au style particulier, que le réalisateur va utiliser pour donner toute cette folie et ce décalage à son œuvre. Deux acteurs, un peu oubliés maintenant, alors qu’ils ont su faire leur place dans un cinéma français pendant plusieurs décennies, souvent en second rôles mais toujours aussi marquants. C’est également l’occasion de retrouver Serge Gainsbourg (Le Pacha) dans l’une de ses plus grandes apparitions au cinéma, avec un rôle qui met en valeur son talent d’artiste décalé et de musicien.